暴雨过后，北京市卫生局、市疾病预防控制中心、市卫生监督所等部门迅速行动，以有效预防和控制暴雨洪涝后传染病疫情、食源性疾患和饮用水污染等突发公共卫生事件。疾控部门提醒市民，不吃被雨水浸泡过的食品，不吃霉变米面，接触雨水的市民要用清水充分洗净，以免引发各种皮肤炎症。

市卫生局表示，灾情严重的区县要及时组织专家对灾后饮用水、食品、公共场所中可能对健康有害的因素进行风险评估和形势研判，评价健康危险。重点落实饮用水，尤其农村自备水井以及食品、环境卫生措施，保证饮用水和食品安全。同时协助有关部门做好垃圾污物、人畜粪便等环境卫生学处理，消灭蚊、蝇孳生地，开展灭鼠，努力消除传染病可能发生或传播的条件。

市疾控中心建议，受灾地区市民特别要注意饮水卫生，应饮用开水或瓶装水，不要饮用生水或地表水，避免因水源水被污染造成疾病传播。同时，注意及时清理居室周边雨水、垃圾，减少蚊虫滋生，同时注意防蚊和灭蝇。雨水严重的地区要特别做好厕所、垃圾、粪便等关键环节的卫生，提早采取必要的卫生干预措施。