（昭和62年是1987年）
据1998年5月统计，开本小学生营养午餐的实施率为99.4%(761万人);中学生营养午餐的实施率为82.2%(360万人)。随着日本经济的发展，饥饿问题已不再存在，但学生营养过剩与摄人不足的比侧在增加，学生的饮食习惯也出现不少新问题，因此，日本文部省对实施营养午餐的目的进行了调整，强调要以饮食为中心，对学生进行营养教育，指导学生合理营养。
午餐费用家长、政府分摊
学校营养午餐的价格约为市场价格的二分之一甚至三分之一，特困生午餐免费
国家与地方财政对学校营养午餐给予经费补贴，中央财政负责提供配餐中心及学校配餐室的硬件与设备，地方政府(县、市、町、村)提供配餐中心及学校配餐室工作人员的工资及运输费用等、学生家长只交营养配餐的原材料费。固此，学校营养午餐的价格约为市场价格的二分之一甚至三分之一，约250—300日圆(合人民币19-23元)。对特困学生，免费为其提供午餐，免费午餐的费用由国家和地方财政各支付50%。一般来说，每所小学每月的“营养午餐”支出约3968美元，初中的支出是4529美元。
父母经济困难而无力支付午餐费，学生可获得地方政府提供的午餐和学费援助
在营养午餐价格远远低于市场价的情况下，日本文教大臣2009年在接受“Japan Times”采访时透露，营养午餐制度所面临的一大问题还是有的家长不愿付钱。日本文教省的调查结果显示，在2005财年，有98993个学生的家长没有支付营养午餐费，占全国学生总数的1%。调查中，60%的小学和初中认为，不支付营养午餐费的家长没有责任心和道德感。文教大臣说，以前人们不支付午餐费是因为经济困难，现在可能是其他原因。2008年，包括神奈川县政府在内的一些日本地方政府决定向因为父母经济原因而没有支付午餐费的学生提供午餐和学费援助。
地方政府提供配餐中心及学校配餐室工作人员的工资及运输费用等、学生家长只交营养配餐的原材料费，故营养午餐价格一般低于市场价。
